【China Science Daily】 소닉 토토원들은 먼저 중국 물의 "Plant World Giant Panda"게놈지도를 그려

베이징 농업 대학 팀과 중국 농업 과학 아카데미의 생명 공학 소닉 토토소는 처음으로 중국 수박의 고품질 게놈지도를 그렸습니다. 이것은 또한 비 씨앗 식물에서 염색체 수준에서 조립 된 것으로보고 된 최초의 사면체 게놈이다. 이 소닉 토토는 소나무 식물의 진화 및 환경 적 적응성과 중국 물 부추의 보호를 추가로 분석하기위한 중요한 토대를 제공합니다.

최근에, 관련 소닉 토토는 Academic Journal Gigabit Science에 "염색체 수준의 사면형 중국 물 게놈을 통한 중국 물 부추 게놈의 진화와 적응"이라는 제목으로 출판되었습니다.

중국 물 부추. 소닉 토토팀이 제공 한 사진

중국 물 부추 게놈지도. 소닉 토토팀이 제공 한 사진

중국 물 부추는 "Plant World Giant Panda"로 간주됩니다. 그들은 우리 나라에서 발표 한 최초의 I- 레벨의 주요 보호 야생 식물이며, 중국의 리토 핀 식물에 고유 한 것입니다. 모든 혈관 식물 그룹 중에서 소나무 소나무는 가장 긴 진화 역사를 가지고 있으며 지구의 생물 다양성, 토양 형성 및 이산화탄소 고정에 중요한 영향을 미칩니다. 그러나 종자 식물과 비교하여 소나무 속 소나무 식물의 분포 영역이 크게 감소되었으며 여러 종의 소나무 속이 멸종 위기에 처해 있습니다. 중국 물 부추는 고대 사면체 (2n = 4x = 44) 수생 소나무 식물입니다. 중국의 물방은 한때 널리 분포되었지만 이제는 대부분의 서식지에서 사라졌습니다. 중국 수분 부추의 게놈지도의 매핑은 소나무 식물의 진화와 환경 적 적응성과 중국 물 부추의 보호에 대한 깊은 이해에 큰 의미가 있습니다.

이 소닉 토토는 22 개의 염색체 2.13 기가 바트를 함유 한 중국 물 부추 사트라 플로이드 게놈을 조립하기 위해 2 세대 및 3 세대 게놈 시퀀싱과 HI-C 데이터를 결합하여 86.66 기가비트에 도달했습니다. 관련 이배체 대만 물 부추와의 비교 분석을 통해, 사면체 게놈의 특성과 사면체 식물의 특성뿐만 아니라, 중국 물 부추와 대만 물 부추와 정체 된 산 발달의 대사 경로와 정체 된 산의 유사성과 차이점이 밝혀졌다. 진화론 적 대표 종과의 비교 분석을 통해, 중국 물 부추는 전사 조절, Abscisic acid, 사이토 키닌, 에틸렌, 재스몬 산 및 지베 렐린 신호 경로와 같은 일반적인 유전자 조절 특성을 가지고 있음이 밝혀졌습니다. 한편, 유니 코리드 및 살리실산의 대사에 관여하는 몇 가지 중요한 유전자와 스트레스 반응 (차가운, 가뭄, 염분 및 카드뮴)도 발견되었으며 중국의 물 부추와 많은 리소프 파일 룸 식물에서 "잃어버린"것입니다. 이러한 결과는 소나무 소나무 식물의 발달에 대한 새로운 통찰력과 역경 스트레스에 대한 적응성을 제공하고 중국 물 부추 보호를위한 중요한 정보를 제공합니다.

베이징 농업 대학교는 베이징 농업 대학교 (Beijing Agriculture University)의 원예 학교의 수석 실험가 인 Cui Jinteng, Zhu Yunke의 최초의 완성 된 단위이며, 생명 공학 소닉 토토소 (Agricultural Sciences)의 중국 아카데미 (Academy Ac 중국 농업 과학 아카데미 인 생명 공학 소닉 토토소 (Institute of Biotechnology)는이 논문의 상응하는 저자이며, 베이징 농업 대학의 학부생 인 Shen Siqian, Wang Tongxin 및 Cui Wenwen 이이 소닉 토토 작업에 참여했습니다.

관련 논문 정보 :https : //doi.org/10.1093/gigascience/giad079

https : //news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510559.shtm