Beijing Agricultural College의 Xiaodou Research 팀은 "염색체 수준의 고품질 Xiaodou 레이싱 토토 및 PBJ에서 Xiaodou Evolution 및 Agronomic 특성 가축화를 드러냅니다"

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Xiaodou의 기원은 논란의 여지가 있으며, 지배 메커니즘은 여전히 ​​불분명하며 기준 레이싱 토토의 연속성은 열악합니다 고품질 레이싱 토토 시퀀싱, 완전한 레이싱 토토 어셈블리 및 레이싱 토토 전체 연관 분석을 통해 콩의 순응 메커니즘과 콩 육종의 개선에 대한 연구에 중요한 중요성을 제공 할 수 있으며, 다른 콩의 가축화 및 번식에도 도움이 될 수 있습니다

최근 BGI와 공동으로 베이징 농업 대학의 Xiaodou Research 팀은 중국 과학 아카데미 및 호주 및 기타 단위의 Modock University의 유전학 연구소 및 발달 생물학과 밀접하게 협력했습니다 2 세대 및 3 세대 시퀀싱 기술을 사용하고 Hi-C 염색체 보조 조립과 결합 된 Xiaodou Jingnong No 6 레이싱 토토 시퀀싱 및 어셈블리가 성공적으로 완료되었습니다 동시에, 322 Xiaodou 생식 질 자원이 재정비하고 있었고, 14 개의 농경질 적 특성 표현형이 확인되었고, 레이싱 토토 전체 연관 분석이 수행되어 다수의 후보 유전자를 수득 하였다 관련 연구 결과는 Plant Biotechnology Journal (https://doiorg/101111/pbi14337)에 게시됩니다

레이싱 토토 업데이트는 염색체 수준에서 고품질 레이싱 토토을 얻었고, Contig N50은 약 16MB였으며, 서열 로딩 속도는 978%에 도달했으며, 32,738 개의 단백질-인코딩 된 유전자는 주석에 의해 얻어졌다

그림 1 Jingnong No 6 레이싱 토토 어셈블리

비교 유전체학은 유전자 패밀리의 진화와 포괄적 인 계통 발생 트리의 획득을 연구하여 Xiaodou와 11 개의 다른 종 사이의 독특하고 공유 된 유전자 패밀리를 식별합니다 Xiaodou의 염색체 3 및 5는 골절과 융합을 겪었으며, Xiaodou의 염색체 5는 Cowpea 속에 독립적으로 존재하며 별도로 길 들여질 수있는 중요한 간격을 가지고있는 것으로 밝혀졌습니다

그림 2 작은 콩, 녹두 및 cowpeas의 비교 유전체학 분석

전체 레이싱 토토 재현 분석은 322 개의 야생 콩, 반장 콩, 경작 된 콩 국소 품종 및 다양한 원천의 경작 콩에 대해 수행되었으며, 중국의 야생 콩은 유전 적 다양성이 높고 가장 원시적 인 유형임을 보여줍니다 중국의 양호트 강의 중간과 하위는 콩의 기원과 길의 중심이되어야한다고 추측된다 작은 콩의 포괄적 인 레이싱 토토 돌연변이 맵이 구성되어 작은 콩의 진화 및 가축화 패턴을 나타냅니다

그림 3 322 야생 콩 및 재배 콩의 인구 구조 분석

Xiaodou 염색체 5는 가축화에서 중요한 역할을합니다 후보 유전자 VACYCA3 및 1의 단일 SNP 변이체는 POD 특성과 밀접한 관련이 있으며, 후보 유전자 VAHB15의 단일베이스 SNP 변이체는 성숙 단계와 관련이있다

그림 4 레이싱 토토 전체 연관 분석 및 길 들여진 특성의 선택 간격

VAANR1 및 VABM, 콩 종자 색상의 종자 색상의 종자 색상의 중요한 후보 유전자는 각각 염색체 1 및 염색체 8에서 확인되었다 일배 체형 분석, OMICS 및 유전자 분석은 VAANR1 유전자의 코딩 서열에서 SNP 변이체가 콩 종자 색상의 종자 색상의 가축을 유발하는 중요한 요소 일 수 있음을 발견했다 후보 유전자 VABM에 대한 3 가지 일배 체형이 있으며, 그 중 CC 일배 체형은 시드 코트에 검은 반점을 나타내지 않으며 모든 야생 콩 종자 코트에는 어두운 반점이 있습니다

그림 5 콩 씨앗의 종자 색상의 전체 레이싱 토토 분석

Bai Liwei, Beijing Agricultural College (현재 Dalian University의 강사)의 대학원생, Yang Kai 교수, Zhao Bo 부교수 및 BGI의 Chen Chunhai 교수, 논문의 공동 소장 작가, Beijing Agricultural College의 Wan Ping 교수, Jianbo, J Jianbo의 연구원은 논문의 공동 소장 작가입니다 중국 과학 아카데미의 유전학 연구소 및 개발 연구소의 Zhixi는 호주 Modock University의 Rajeev K Varshney 교수는 논문의 공동 응답 저자이며, 미국 농업부의 Beltsville 농업 연구 센터의 연구원 Qijian 연구원 및 Snenschein 교수는이 연구를 위해 중요한 지침과 지원을 제공합니다 이 연구는 National Key R & D Plan, National Natural Science Foundation, Beijing Municipal Education Commission의 주요 프로젝트 및 베이징 농업 대학과 같은 프로젝트에 의해 자금을 지원했습니다 Nanjing Agricultural University의 Academician Gai Junyi와 Yang Shouping 교수는 재료 식재장을 제공하는 데 도움을주었습니다

연구팀의 교사와 학생들은 학교의 제 4 차 의회의 정신을 완전히 구현하고, "업무 구현의 해"의 배치 요구 사항을 자세히 구현할 것이며, 과학적 연구를 돕기위한 과학 및 기술 혁신을위한 행동 계획 "에 중점을두고, 과학적 연구와 지속적으로 과학적 연구를 개선하고, 높은 수준의 결과를 유지하고, 긍정적 인 결과를 유지하고, 긍정적 인 공동을 만들어 냈습니다 중국에서 일류 및 국제적으로 유명한 도시 농업 및 임업 특성을 가진 대학